微波化學污水處理技術的基礎是“極性分子理論”。外加微波場可使這些極性分子因趨向作用而發生頻率極高的振蕩運動，消耗能量而發熱。在微波場中物質的吸波與否和吸波強弱，與該物質的電性質有關。
實驗證明，在單位體積的物質內被吸收的微波功率Pa，與電場強度E、物質的損耗角正切tgδ和頻率f成正比關系。物質在微波場中吸收的微波能全部轉化為熱能，所以Pa即為單位時間內在單位體積物質中產生的能量。與該物質的介電常數、介電損耗相關的量，而物質的介電常數、介電損耗又與該物質當時的其它多種因素相關。
第一、消解罐在腔體內擺放不均勻
微波消解儀微波在腔體內是均勻分布的，但是微波有一定的穿透厚度，如果出現主控罐周圍有兩個消解罐包圍的話，腔體本身有六個反射面，有兩個反射面過來的微波被它周圍的兩個消解罐吸收了，主控罐吸收微波的功率就降低了1/3。
第二、消解罐內溶劑不一致
因為每種酸、每種溶劑對微波的吸收效率不一樣，在同樣條件下，有的溶劑吸收微波的效率很高，導致在消解過程中跟主控罐溫度不一致，如果高于主控罐，就會產生瀉壓。比如主控用的是硝酸，空白里面有一個蒸餾水，這樣，蒸餾水吸收微波的效率就很高，在同樣的條件下，主控可能在170度的時候，蒸餾水的溫度就已經超過260度了。
第三、微波消解系統采用內置的Pt100鉑電阻進行精確的測溫控制，實時監控高達300℃的溫度，溫控精度：±0.5℃。性能穩定，耐用微波消解系統采用直接接觸式壓力測量方式，壓力反映真實、準確，實時監控達900psi，控制精度：0.01MPa。
第四、國產微波消解系統同批次最多同時處理10個樣品。
第五、安全膜片保護壓力分別為中壓200psi，高壓400psi。
第六、微波消解系統通過PID控制改變微波頻率來調整不同的輸出功率，提高電源部分的效率，減少了待機時的耗量，比傳統微波爐節電20%以上。另外，變頻技術的引進也減小了儀器的工作噪音。
